При изменении в конфигурационном файле параметра innodb_log_file_size многие потом при запуске получают ошибку вида:

MySQL-сервер, как и любой другой сложный продукт, имеет множество настроек. К сожалению, не существует какого-то универсального конфига, который бы подходил на любые случаи жизни, ведь решаемые задачи и используемые приложения у каждого разные. Кроме того, значения многих настроек в первую очередь определяются конфигурацией оборудования: объёмом доступной оперативной памяти, количеству ядер процессора и т.д.

Дело всего лишь в одном параметре конфигурации: innodb_flush_log_at_trx_commit

По умолнчанию, его почему-то решили выставить в 1, что означает, что InnoDB сбрасывает буферы на диск при каждой транзакции. Т.е. ЛЮБОЕ изменение данных приводит к синхронизации с диском, что страшно медленно и просто насилует диск по полной программе. В /etc/my.cnf в секции [mysqld] выставьте этот параметр в значение 0 или 2, т.е.